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科学家在白腹鼠属系统发育研究中取得进展,昆

近日,BMC Evolutionary Biology 发表了中国科学院昆明动物研究所蒋学龙课题组题为Multi-locus phylogeny using Topotype specimens sheds light on the systematics ofNiviventer(Rodentia, Muridae) in China 的研究论文,该文介绍了其在白腹鼠属系统发育研究中取得的进展。昆明动物所博士研究生张斌和助理研究员何锴为文章共同第一作者,研究员蒋学龙与何锴为共同通讯作者。

科学家在白腹鼠属系统发育研究中取得进展

青藏高原及其邻近的中国西南山地是现生鼠兔的分布中心,这一区域的鼠兔物种占整个类群物种数量的1/3以上(Hoffmann & Smith, 2005)。尽管如此,鼠兔的分类与系统演化研究并没有对这一区域的鼠兔多样性予以足够的重视。最近的研究表明,青藏高原及其邻近区域的鼠兔物种多样性被低估,继而引发了一系列鼠兔分类与系统演化方面的疑问(Lissovsky, 2014 Mammalia; Melo-Ferreira et al., 2015 Mol. Phylogenet. Evol)。

白腹鼠是一类分布于东南亚和中国大部地区的啮齿类动物,受限于其形态的相似性和模式标本保存地的分散性,白腹鼠属物种归属和界定与系统学一直存在诸多争议。

中科院昆明动物所近日在白腹鼠属系统发育研究中取得进展,该研究成果发表于《BMC进化生物学》。

为了厘清鼠兔的分类与系统发育问题,进一步探讨青藏高原隆升对鼠兔物种分化与多样性的影响,中国科学院昆明动物研究所蒋学龙课题组与四川林科院研究员刘少英开展合作。研究人员通过分子系统学手段对鼠兔3个亚属的11个物种共96号标本进行了分析。结果显示,采集自秦岭地区的标本自成一支,有别于所有已知的亚属,因此应该作为全新的鼠兔亚属以正名。分子物种界定很好地支持了采集自陕西、四川和云南的标本为隐存种,进一步揭示了中国西南分布的鼠兔的物种多样性。此外,分歧时间估算显示鼠兔的5个亚属在中中新世(约13.90 Ma)经历了快速分化。尽管目前的数据仍不能完全解决亚属之间的系统发育问题,但提示了未来从组学角度开展进一步工作的可能性。

为解决白腹鼠属系统发育关系、厘定其分类系统、评估其物种多样性,蒋学龙课题组通过大量文献回溯,并在中国广泛采样(白腹鼠属各物种、亚种和同物异名的地模标本)及收集邻近地区的样品,使用分子系统学方法对标本和样品进行比较分析。结果表明,白腹鼠属可以分为4个主要分支,各分支之间的系统发育关系得到了很好的解决;分子物种界定分析表明白腹鼠属物种多样性被低估,在中国范围内至少存在11个种,包括3个隐存种,同时多个物种的分类地位需要重新评估,包括亚种。尽管目前的数据尚不能完全地解决白腹鼠属系统发育关系以及物种多样性问题,但提示从基因组学方面解决问题的可能性。

白腹鼠是一类分布于东南亚和中国大部地区的啮齿类动物,受限于其形态的相似性和模式标本保存地的分散性,白腹鼠属物种归属和界定与系统学一直存在诸多争议。

相关工作目前以Multilocus approaches reveal underestimated species diversity and inter-specific gene flow in pikas from southwestern China 为题发表于《分子系统发育与进化》(Molecular Phylogenetics and Evolution),尼泊尔籍博士生Narayan P. Koju和何锴博士为文章的共同第一作者,蒋学龙与何锴为共同通讯作者。该研究得到了中科院重点部署项目(KJZD-EW-L07)的资助。

该研究得到了国家自然科学基金(No. 31272276)和中科院遗传资源与进化国家重点实验室开放课题(GREKF13-07)的资助。

为解决白腹鼠属系统发育关系、厘定其分类系统、评估其物种多样性,蒋学龙课题组通过大量文献回溯,通过在中国广泛采样(白腹鼠属各物种、亚种和同物异名的地模标本)及收集邻近地区的样品,使用分子系统学方法对标本和样品进行比较分析。

论文链接

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结果表明,白腹鼠属可以分为4个主要分支,各分支之间的系统发育关系得到了很好地解决;分子物种界定分析表明白腹鼠属物种多样性被低估,在中国范围内至少存在11个种,包括3个隐存种,同时多个物种的分类地位需要重新评估,包括亚种。尽管目前的数据尚不能完全地解决白腹鼠属系统发育关系以及物种多样性问题,但提示从基因组学方面解决问题的可能性。

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拍摄自尼泊尔朗塔国家公园(Langtang National Park)的Royle鼠兔以及本研究呈现的现生鼠兔物种树

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